মানুষের মস্তিষ্ক গঠনগতভাবে অত্যন্ত জটিল । আমাদের দেহের সকল শরীরাবৃত্তীয় কার্যাবলী মস্তিষ্ক নিয়ন্ত্রণ করলেও আমরা কখোনই আমাদের ইচ্ছানুযায়ী মস্তিষ্ককে সেভাবে নিয়ন্ত্রণ করতে পারি না। আমরা আমাদের চিন্তা, আবেগ এবং আচরণের একটি বড় অংশ নিয়ন্ত্রণ করতে পারি, তবে পুরোপুরি মস্তিষ্ককে নিয়ন্ত্রণ করা সম্ভব নয়। মস্তিষ্কের কিছু অংশ এবং কার্যকলাপ আমাদের নিয়ন্ত্রণের বাইরে থাকে, কারণ মস্তিষ্কের অনেক কাজ স্বায়ত্তশাসিত এবং অবচেতন স্তরে ঘটে। উদাহরণস্বরূপ: হৃদস্পন্দন, শ্বাসপ্রশ্বাস, এবং হজমের মতো প্রক্রিয়াগুলি ব্রেইনস্টেমের মাধ্যমে স্বায়ত্তশাসিতভাবে নিয়ন্ত্রিত হয়, যা আমাদের সচেতন নিয়ন্ত্রণের বাইরে। মস্তিষ্কের মধ্যে প্রচুর পরিমাণে নিউরাল নেটওয়ার্ক এবং রাসায়নিক প্রক্রিয়া রয়েছে। আমাদের সচেতন মন মস্তিষ্কের এই সকল প্রক্রিয়াকে পুরোপুরি বুঝতে বা নিয়ন্ত্রণ করতে সক্ষম নয়।

যদিও আমরা পুরোপুরি মস্তিষ্ককে নিয়ন্ত্রণ করতে পারি না, তবে ধ্যান, মনন এবং মানসিক প্রশিক্ষণের মাধ্যমে কিছুটা হলেও মস্তিষ্কের কার্যকলাপের ওপর নিয়ন্ত্রণ বাড়ানো সম্ভব। উদাহরণস্বরূপ, ধ্যান এবং মাইন্ডফুলনেস প্র্যাকটিসের মাধ্যমে মনকে শান্ত করা, আবেগ নিয়ন্ত্রণ করা এবং কল্পনা শক্তিকে বৃদ্ধি করা সম্ভব।